Le Panama présente une grande palette de paysages, mariant côtes tropicales et montagnes verdoyantes. Au nord, ses frontières sont façonnées par les eaux cristallines de la mer des Caraïbes, tandis qu'au sud, elles s'étirent le long de la côte du Pacifique.
Des plaines étendues côtoient les sommets des montagnes, créant une topographie marquée. Traversé par une chaîne montagneuse d’est en ouest, le Panama offre des reliefs imposants. Le volcan de Chiriquí (ou Barú), qui appartient à la cordillère de Talamanca, culmine à 3 474 m. À la pointe est du pays, débute la cordillère des Andes, qui se prolonge en Colombie.
Des vallées fertiles, telles que celles de la province de Chiriquí, sont des terres propices à l'agriculture, tandis que la profondeur de certains canyons s’avère spectaculaire. La diversité géologique du Panama se révèle également à travers de nombreuses forêts tropicales, telles que celle du parc national de Darién, et les plaines sèches de la péninsule d'Azuero.
De nombreuses îles ponctuent également le territoire. Au sud, dans l’océan Pacifique, l’île de Coïba est la plus vaste d’entre elles, tandis qu’à la pointe septentrionale du pays, se trouve l’archipel de San Blas, constitué de 365 îlots, dont certains sont habités.